НП «НИЦ ИнЭн» обладает широкой партнерской сетью, в которую входят представители различных отраслей - науки, бизнеса, федеральных органов исполнительной власти.

Электороэнергетический сектор:

• ОАО "РусГидро"
• ОАО "Интер РАО"
• ОАО "Мосэнерго"
• ОАО "Россети"
• ЗАО «МРСЭН»
• ООО «Энергетический Стандарт»

Машиностроительный сектор:

• ООО "Энергостандарт"
• ОАО «Машиностроительный завод «ЗиО — Подольск»
• Компания «ALKARGO» (Испания)
• Компания «MONDRAGON Componentes S. Coop» (Испания)
• Группа компаний «R’AIN GROUP»
• ОАО «РЖД»

Финансовый сектор:

• Инвестиционная компания «Еврофинансы»
• Petrofin OY (Финляндия)
• Россельхозбанк

Эксперты и научные организации:

• ООО «Экологические Системы»
• ЗАО «АлькаТэк»
• Научно-производственная фирма «ЭКИП»
• ОАО «ВТИ»
• Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева
• Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт нефтехимического синтеза им. А.В. Топчиева Российской академии наук

Федеральные органы исполнительной власти:

• Министерство промышленности и торговли РФ
• Министерство экономического развития РФ
• Министерство образования и науки РФ

НП "НИЦ ИнЭн" является участником следующих технологических платформ (ТП):

• «Экологически чистая тепловая энергетика высокой эффективности»
• «Интеллектуальные энергетические системы России»
• «Перспективные технологии возобновляемой энергетики»